5 საერთო საღებავები დნმ-ისთვის და დნმ-ის ვიზუალიზაციისათვის

არსებობს რამდენიმე სხვადასხვა stains, რომელიც შეიძლება გამოყენებულ იქნას ვიზუალურად და ფოტოსურათის დნმ მას შემდეგ, რაც მასალა გამოყოფილია ლარი ელექტროფორეზის. ბევრი არჩევანი, ამ ხუთი შტამების ყველაზე გავრცელებული დასაწყისია Ethidium bromide, რომელიც ყველაზე ფართოდ გამოიყენება. ამ პროცესთან მუშაობისას მნიშვნელოვანია არა მარტო განსხვავებები შტამების, არამედ თანდაყოლილი ჯანმრთელობის რისკის შესახებ.

  • 01 ეტიდიუმის ბრომიდი

    ეტიდიუმის ბრომიდი სავარაუდოდ ყველაზე კარგად ცნობილი საღებავი გამოიყენება დნმ-ის ვიზუალიზაციისათვის. ეს საღებავი შეიძლება გამოყენებულ იქნას გელ ნარევი, ელექტროფორეზის ბუფერში ან გელვის საწინააღმდეგოდ. საღებრის მოლეკულები აკმაყოფილებენ დნმ-ს ფენას და ფლუორესსს UV სინათლის ქვეშ, რაც აჩვენებს ზუსტად იმას, თუ სად არიან ბენდები ლარში. მისი უპირატესობის მიუხედავად, უარყოფითად არის ის, რომ ეტიდიუმის ბრომიდი პოტენციური კანცეროგენურია, ამიტომ უნდა მოექცნენ დიდ ყურადღებას. ამ ლარით მუშაობის პოტენციური ჯანმრთელობის რისკის გამო, ალტერნატივები იქნა ნაპოვნი.
  • 02 SYBR ოქრო

    SYBR ოქროს საღებავი შეიძლება გამოყენებულ იქნეს ორმაგი ან ცალკეული დნმ-ს, ან RNA ლალისთვის. SYBR ოქრო იყო ეტიდიუმის ბრომიდის ერთერთი პირველი ალტერნატივა, რომ მოხვდა ბაზარი და ის უფრო მგრძნობიარეა, ვიდრე ეთიომის ბრომიდი. საღებავი ექსპონატების 1000-ჯერ უფრო დიდი UV ფლუორესცენტად იქცევა, როდესაც იგი ნუკლეინის მჟავებს უკავშირდება. მას შემდეგ აღწევს სქელი და მაღალი პროცენტული აარარუსის ლარით და შეიძლება გამოყენებულ იქნას ფორმალდეჰიდის ლარებში.

    იმის გამო, რომ შემოფარგლული მოლეკულის ფლუორესცენცია იმდენად დაბალია, არ არის საჭირო. ლიცენზირებულმა მოლეკულურმა პრობებმა (SYBR- ის ოქროს წარმოების შემდეგ) შეიმუშავეს და გაამჟღავნეს SYBR სეიფი და SYBR მწვანე, რომლებიც უსაფრთხოა ალვედიუმის ბრომიდის ალტერნატივა.

  • 03 SYBR მწვანე

    SYBR მწვანე I და II stains (კვლავ ბაზარზე მოლეკულური პრობები) ოპტიმიზირებულია სხვადასხვა მიზნებისათვის. იმის გამო, რომ ისინი დნმ-ს აკავშირებენ, ისინი ჯერ კიდევ განიხილება პოტენციური მუტაგენები და ამის გამო ისინი უნდა მოექცნენ ზრუნვას. SYBR მწვანე მეტად მგრძნობიარეა ორმაგი Stranded DNA- ით, ხოლო SYBR Green II, მეორე მხრივ, ერთჯერადი დნმ-ის ან RNA- ს გამოყენებისას. როგორც პოპულარული Eididium Bromide stain, ამ მაღალი მგრძნობიარე stains fluoresce ქვეშ UV ნათელი.
  • 04 SYBR უსაფრთხო

    SYBR სეიფი განკუთვნილია ეტიდიუმის ბრომიდის და სხვა SYBR ლაქების უსაფრთხო ალტერნატივად. ეს არ ითვლება სახიფათო ნარჩენებით და ზოგადად შეიძლება განლაგდეს რეგულარული საკანალიზაციო სისტემების საშუალებით (მაგ. ქვემოთ გადინება), რადგან ტოქსიკურობის ტესტირება მიუთითებს იმაზე, რომ არ არსებობს მწვავე ტოქსიკურობა. ტესტირება ასევე მიუთითებს იმაზე, რომ არსებობს პატარა ან არ გენოტოქსიურობა სირიის ჰამტერის ემბრიოს, ადამიანის ლიმფოციტების, მაუსის ლიმფომის საკნებში და AMES ტესტში. კანი შეიძლება გამოყენებულ იქნას ლურჯი სინათლის ტრანსლიუმუმინით, რომელიც იწვევს დაზიანებულ დნმ-ზე ნაკლებად დაზიანებას და მოგვიანებით კლონირებისთვის უკეთესი ეფექტურობას სთავაზობს.
  • 05 ევა მწვანე

    ევა მწვანე არის მწვანე ფლუორესცენტური საღებავი, რომელიც აღმოაჩინა PCR- ს ნაკლებად, ვიდრე სხვა საღებავებს. ეს ხდის ძალიან სასარგებლო განაცხადების როგორიცაა რაოდენობრივი რეალურ დროში PCR. ასევე კარგი არჩევანია, თუ დნმ-ის აღდგენისთვის დაბალი დნობის წერტილის გამოყენებით. ძალიან მაღალია ტემპერატურის მაღალი ტემპერატურა და ძალიან დაბალია ფლუორესცენტობა, მაგრამ დნმ-სთან არის დაკავშირებული ძალიან ფლუორესცენტული. ევა გრინმა ასევე აჩვენა, რომ ძალიან დაბალი ან ციტოტოქსიურობა ან მუტაგენურობა.