Რატომ ხდება E.coli გამოიყენება გენების კლონირებისათვის

by ტერეზა ფილიპსი

მრავალენოვანი მიკროორგანიზმი წარმოუდგენელი პოტენციალით

მიკროორგანიზმი Escherichia coli- ს დიდი ისტორია აქვს ბიოტექნოლოგიის ინდუსტრიაში და კვლავაც გამოიყენება მიკროორგანიზმზე საუკეთესო გენი კლონირების ექსპერიმენტებისთვის. მიუხედავად იმისა, რომ E. coli ცნობილია ერთი კონკრეტული დაძაბულობის (0157: H7) ინფექციური დაავადებების საერთო მოსახლეობისთვის, რამდენიმე ადამიანმა იცის, თუ რამდენად მრავალმხრივი და სასარგებლო E. coli არის გენეტიკური კვლევა. არსებობს რამდენიმე მიზეზი, რომ E. coli გახდა ფართოდ გავრცელებული და კვლავ საერთო მასპინძელი დნმ-ისთვის.

01 გენეტიკური სიმარტივე

ბაქტერია სასარგებლო მექანიზმებს გენეტიკური კვლევისთვის ეკუმორეტების შედარებით შედარებით მცირე გენომის გამო. E. coli- ს უჯრედებში მხოლოდ 4,400 გენია, ხოლო ადამიანის გენომის პროექტმა დაადგინა, რომ ადამიანებში დაახლოებით 30 000 გენის შემცველობაა. გარდა ამისა, ბაქტერიები, მათ შორის E. coli , ცხოვრობენ მთელი სიცოცხლის განმავლობაში haploid სახელმწიფო (რომელსაც ერთი კომპლექტი unpaired ქრომოსომა). შედეგად, არ არსებობს მეორე კომპლექტი ქრომოსომა, რათა პროტეინის საინჟინრო ექსპერიმენტების დროს მუტაციების ეფექტის ნიღაბი გახდეს.

02 ზრდადი განაკვეთი

ბაქტერიები, როგორც წესი, უფრო სწრაფად იზრდება, ვიდრე უფრო რთული ორგანიზმები. E. coli სწრაფად იზრდება ერთი თაობის მაჩვენებელზე ოცი წუთის განმავლობაში ტიპიური ზრდის პირობებში. ეს საშუალებას იძლევა ლოგ-ფაზის მომზადება (მაქსიმალური სიმკვრივის შუალედში) კულტურების ღამით და გენეტიკურ ექსპერიმენტულ შედეგებს მხოლოდ რამდენიმე საათში ნაცვლად რამდენიმე დღის განმავლობაში, თვეების ან წლების ნაცვლად. უფრო სწრაფად განვითარება ნიშნავს იმას, რომ პროდუქციის უკეთესობის დონე, როდესაც კულტურები გამოიყენება მასშტაბური ფერმენტაციის პროცესებში.

03 უსაფრთხოება

ეკოლიზი ბუნებრივად გვხვდება ადამიანისა და ცხოველების ნაწლავურ ტრაქტებში, სადაც იგი უზრუნველყოფს მასპინძლებს (ვიტამინებს K და B12) უზრუნველყოფს. არსებობს სხვადასხვა შტამები E. coli, რომელიც შეიძლება წარმოიქმნას ტოქსინები ან გამოიწვიოს სხვადასხვა დონის ინფექცია, თუ შეყვანილი ან დაშვებული შეჭრა სხეულის სხვა ნაწილები. მიუხედავად იმისა, რომ ერთი განსაკუთრებით ტოქსიკური შტამის ცუდი რეპუტაცია (O157: H7), E. coli ზოგადად შედარებით უვნებელია, თუ გონივრულ ჰიგიენასთან.

04 E. Coli გენომ კარგად იცის

E. coli გენომის პირველი იყო სრულიად sequenced (1997 წელს). შედეგად, E. coli არის ყველაზე მაღალკვალიფიციური მიკროორგანიზმი. მისი პროტეინის გამოხატვის მექანიზმების შემეცნებითი ცოდნა უფრო მარტივია ექსპერიმენტებისთვის, სადაც უცხოური პროტეინების გამოხატვა და რეკომბინანტების შერჩევა აუცილებელია.

05 უცხო დნმ-ს მასპინძლობის უნარი

ამ ბაქტერიის გამოყენებით განვითარდა გენი კლონირების მეთოდები და კიდევ უფრო წარმატებული ან ეფექტურია E. coli- ში, ვიდრე სხვა მიკროორგანიზმებში. შედეგად, არ არის გართულებული კომპეტენტური უჯრედების (საკნები, რომლებიც მიიღებენ უცხო დნმ-ს) მომზადებას. ტრანსფორმაციები სხვა მიკროორგანიზმებით ხშირად ნაკლებად წარმატებულია.

06 E კოლი ადვილად ზრუნავს

იმის გამო, რომ იგი იზრდება ისე კარგად ადამიანის ნაწლავის, E. coli აღმოაჩენს ადვილად იზრდება, სადაც ადამიანები შეიძლება მუშაობა. მაგალითად:

ეს ყველაზე კომფორტულია სხეულის ტემპერატურაზე. მიუხედავად იმისა, რომ 98.6 გრადუსი შეიძლება იყოს თბილი თბილი ადამიანების უმრავლესობა, ადვილად შეინარჩუნოს ტემპერატურა ლაბორატორიაში.
E. coli ცხოვრობს ადამიანის gut, რაც იმას ნიშნავს, რომ ეს არ არის fussy შესახებ საკვები. არსებითად, მოხარულია, რომ ნებისმიერი სახის გამომუშავებული საკვები მოიხმაროს.
ეს შეიძლება გაიზარდოს როგორც აერო და ისე ანაერობულად. ამრიგად, მას შეუძლია გაიზარდოს ადამიანის ან ცხოველების ნაწლაობაში, მაგრამ თანაბრად ბედნიერია პეტრის ჭურჭელში ან ფლაკონში.

ე.კოლის როგორ განსხვავდება

E. coli არის წარმოუდგენელი მრავალმხრივი ინსტრუმენტი გენეტიკური ინჟინერი; შედეგად, უკვე წარმოებული საოცარი მედიკამენტები და ტექნოლოგიები. პოპულარული მექანიკის თანახმად, ბიო-კომპიუტერისთვის პირველი პროტოტიპი გახდა: "გასული წლის მარტში სტენფორდის უნივერსიტეტის მკვლევარების მიერ შემუშავებული" ეკო კოლოის "ტრანსკრიპტორი, მავთულის და ფერმენტების დნმ-ს დგას ელექტრონებისთვის, ეს არის ნაბიჯი ცოცხალი უჯრედებში სამუშაო კომპიუტერების შესაქმნელად, რომელიც შეიძლება დაპროგრამდეს გენური გამოხატვის ორგანიზმში ორგანიზმში. " ასეთმა ფუნქციამ შეიძლება მხოლოდ შესრულებული ორგანიზმის გამოყენება, რომელიც კარგად არის გასაგები, ადვილი მუშაობა და სწრაფად გაიმეორებს.